Page 180 - 《华中农业大学学报(自然科学版)》2022年第5期
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                                                                2.5  表面疏水性变化分析
                                                                    KNGP对 COX-2表面疏水性的影响通过 COX-2
                                                                中 ANS 荧光强度变化来表示。如图 8 所示,KNGP
                                                                的加入导致 COX-2的表面疏水性降低。KNGP 可能
                                                                与 COX-2 的活性位点的亲水基团相互作用,导致酶
                                                                活性位点内的疏水性基团暴露,从而引起 COX-2 表
                                                                面的亲水基团暴露,使得 COX-2的构象发生变化,抑
                                                                制底物与COX-2的结合。





                        图 6  KNGP对COX-2的RSFQ曲线
                     Fig.6  The corresponding plot of RSFQ of
                               COX-2 with KNGP












                                                                       图 8  KNGP对COX-2的ANS荧光光谱
                                                                Fig.8  ANS-fluorescence spectra of COX-2 with KNGP
                                                                2.6  分子对接结果
                                                                    1)分子对接 ROC 曲线分析。基于 ROC 曲线(图
                                                                9)比较,可以看到-CDOCKER ENERGY(-ECD)曲
                                                                线下面积最大,证实负的受体-配体间的总能量-ECD
                                                                和负的受体-配体相互作用能量-CDOCKER INTER⁃
                                                                ACTION ENERGY(-IECD)能够较好地区分活性和
                                                                非活性分子,可以作为此次分子对接的打分函数,
                                                                且-ECD更能较好地体现分子的活性。其最终计算结
                                                                果,对应-ECD值越高,说明受体与配体间的总能量越
                                                                低,对接体系越稳定。
                                                                    2)分 子 对 接 函 数 打 分 结 果 。 本 研 究 采 用
                                                                CDOCKER 分子对接模式进行模拟,通过模拟退火
                                                                得到了 KNGP、阳性对照(布洛芬和对乙酰氨基酚)
                     图 7 COX-2(A)三维荧光等高线图和在KNGP                 的多个可能的构象,从中选择其中总能量最低的模
                    (0.47 mmol/L)时COX-2(B)三维荧光等高线图              拟结果进行分析和比较。如表 4所示,在模拟对接的
               Fig.7 Three-dimensional  fluorescencespectraofCOX-
                                                                KNGP、布洛芬和对乙酰氨基酚的-ECD 打分分别为
               2 in absence(A)and presence of KNGP(0.47 mmol/L,B)
                                                                250.44、117.25和 61.53 kJ/mol,反映出的相互作用强
               与酶相互作用后蛋白质周围微环境疏水性增强,极
                                                                度由大到小排列为 KNGP >布洛芬>对乙酰氨基
               性减弱。同时,峰 2 的荧光强度也有所降低,荧光强
                                                                酚。可以看出,KNGP 对 COX-2 的抑制作用好于阳
               度从 186.0 下降到 29.41,表明 KNGP-COX-2 复合物
                                                                性药物对照布洛芬和对乙酰氨基酚。表明 KNGP 可
               的形成可能影响蛋白质的二级结构,并导致 COX-2
               构象的松散。                                           能有很好的COX-2抑制活性。
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